สอบถามเรื่องระบาดวิทยาในระดับอณูชีววิทยาครับ

สงสัยครับว่า กรณีที่เราเอาเชื้อไปทำการหาลำดับเบส หรือ sequencing แล้ว สมมติว่าเชื้อ ก. มีลำดับเบสเป็น ATTCGC ,เชื้อ ข. มีลำดับเบสเป็น ATTCCC แบบนี้เราจะบอกได้อย่างไรครับว่า เชื้อตัวไหนเป็นตัวเริ่มต้น และตัวไหนเป็นตัวที่กลายพันธุ์

ผมยกตัวอย่างจากความรู้ในระดับน้อยนิดจริงๆครับ หากมีอะไรมีลึกซึ้งหรือมีหลักการที่ซับซ้อนกว่านี้ ขอความรู้ด้วยครับ ขอบคุณมากๆครับ