เริ่มต้น สมมุติว่า เมกา ประสบความสำเร็จในการใช้นิวเคลียร์ ถล่มโคโนฮะ แบบไม่ทันตั้งตัว
แต่ยังมีเกะนิน โจนิน และจูนิน จำนวนมากหลบซ่อนหนีไปได้ โดยแบ่งเป็น เกะนิน 110คน จูนิน30คน และโจนิน10คน
ทั้ง150 แฝงตัวเข้ามาในแผ่นดินใหญ่สำเร็จ และเป้าหมายคือก่อการร้ายเป็นการล้างแค้นยให้โคโนฮะที่ถูกทำลายไป
เกะนินซึ่ง เป๋นระดับต่ำสุด มีพื้นฐานวิชา พวกธาตัต่างๆ เช่นวิชาลูกไฟ วิชาปลอมตัว แยกร่างเงา พลางตัว ดำดิน อะไรแบบนั้น
หากเมกา เจอก่อการร้ายด้วย ระดับนินจาจากโคโนฮะ และพันธมิตร จะสามารถแก้ไข หรือต้านทานอย่างไรบ้าง
แต่ยังมีเกะนิน โจนิน และจูนิน จำนวนมากหลบซ่อนหนีไปได้ โดยแบ่งเป็น เกะนิน 110คน จูนิน30คน และโจนิน10คน
ทั้ง150 แฝงตัวเข้ามาในแผ่นดินใหญ่สำเร็จ และเป้าหมายคือก่อการร้ายเป็นการล้างแค้นยให้โคโนฮะที่ถูกทำลายไป
เกะนินซึ่ง เป๋นระดับต่ำสุด มีพื้นฐานวิชา พวกธาตัต่างๆ เช่นวิชาลูกไฟ วิชาปลอมตัว แยกร่างเงา พลางตัว ดำดิน อะไรแบบนั้น