เป็นเพราะว่า  เมฆฝนที่มึดดำ  คือเมฆฝนแบบ Cumulonimbus ที่มีการก่อตัวทางสูงขึ้นไปมากครับ

เมฆแบบดำมืดที่เราเห็น  คือเมฆที่มีไอน้ำ และ หยาดน้ำหนาแน่น และ ปริมาณมากครับ  และที่สำคัญคือ
มันก่อตัวทางสูงขึ้นไปได้มากถึง 10 กิโลเมตร  ทั้งที่ฐานเมฆต่ำเพียง 1 กิโลเมตร  นี่คือลักษณะสำคัญ
ของเมฆแบบ Cumulonimbus ครับ

และในเมื่อเมฆก้อนนี้หนามากในแนวตั้งขนาดนั้น  ปริมาณไอน้ำจึงมากไปด้วย  ทำให้มีการสะสม
ประจุไฟฟ้าได้มหาศาลครับ  ทำให้เมฆดำมืดแบบนี้สามารถก่อให้เกิดฟ้าคะนองที่รุนแรงกว่าเมฆทั่วไป

เมฆฝนแบบที่มีฟ้าคะนองน้อย ๆ คือเมฆแบบ Nimbostratus ครับ  คือเป็นเมฆแผ่น
ที่มีความหนาแน่นจนฝนตกได้  แต่ด้วยความที่มันเป็นเมฆแผ่น  มันจึงไม่มีการก่อตัวทางสูง  
ปริมาณไอน้ำก็น้อย  ประจุไฟฟ้าก็น้อย  ฟ้าคะนองภายในเมฆก้อนนั้นก็น้อยตามไปด้วยครับ