ประเทศไทย ถือเป็นแหล่งนำเข้าและส่งออกสัตว์น้ำทั้งแบบสดและแปรรูป ที่ทั่วโลกให้ความสนใจ ดังนั้น ด่านตรวจสัตว์น้ำ จึงมีความสำคัญอย่างยิ่ง ในการป้องกันการนำเข้าและส่งออกสัตว์น้ำที่ผิดกฎหมาย

สำหรับการตรวจสอบ เจ้าหน้าที่จะทำการตรวจสอบประวัติเรือขนถ่ายและเรือประมง, เอกสารรับรองต่างๆ ผ่านเว็บไซต์ขององค์กรที่เกี่ยวข้อง รวมไปถึงบันทึกเส้นทางการเดินเรือขนถ่าย และการขนถ่ายสัตว์น้ำจากเรือประมงทั้งหมด ซึ่งกระบวนการแหล่านี้ ต้องสามารถตรวจสอบย้อนกลับได้ถึงแหล่งน้ำ และประเภทเรือประมง หากมีสิ่งใดไม่ถูกต้อง เจ้าหน้าที่สามารถสั่งห้ามนำเรือขนถ่ายเข้ามาภายในราชอาณาจักรได้โดยทันที แต่ถ้าเอกสารทุกอย่างสามารถยืนยันความถูกต้องได้ทั้งหมด ก็จะอนุญาตให้นำเรือขนถ่ายเข้าเทียบท่าเพื่อตรวจสอบต่อไป

กระบวนการตรวจสอบย้อนกลับนี้ นอกจากจะช่วยให้สามารถยืนยันได้ว่าสัตว์น้ำที่ถูกนำเข้าและส่งออก ได้มาจากการทำประมงที่ถูกต้องแล้ว ยังเป็นการยกระดับมาตรฐานของการทำประมงไทย อุตสาหกรรมอาหาร และแปรรูปสัตว์น้ำของไทย ให้เป็นที่ยอมรับของนานาชาติได้เป็นอย่างดี