คณะนี้เขามีหลักสูตรที่หลากหลายเพื่อตอบสนองความต้องการที่แตกต่างของน้องๆ 

ในระดับปริญญาตรี ดังนี้เลยจ้า 

1. หลักสูตรแพทยศาสตรบัณฑิต (หลักสูตรปกติ 6 ปี) หลักสูตรพื้นฐานสุดคลาสสิกสำหรับผู้ที่ต้องการเป็นแพทย์ทั่วไป

2. หลักสูตรควบ พ.บ. - วศ.ม. (7 ปี) เรียนหมอควบคู่วิศวกรรมชีวการแพทย์ เพื่อสร้างแพทย์นวัตกรที่มีความรู้ด้านเทคโนโลยีทางการแพทย์

3. หลักสูตรควบ พ.บ. - กจ.ม. (7 ปี) เน้นสร้างแพทย์ที่มีความรู้ด้านการบริหารจัดการ เพื่อเป็นผู้นำในระบบสาธารณสุข

4. หลักสูตรควบ วท.บ. - ปร.ด. - พ.บ. (โครงการมหิดลวิทยาจารย์) หลักสูตรที่มุ่งเน้นสร้างแพทย์นักวิจัย เพื่อพัฒนาองค์ความรู้ใหม่ๆ ทางการแพทย์

นอกจากนี้ยังมีหลักสูตรพยาบาลศาสตร์ และฉุกเฉินการแพทย์ด้วยนะ! โดยมักจะเปิดรับในรอบ Portfolio และรอบ กสพท. (รอบ 3) เป็นหลัก