1. ส่วนจัดแสดงภายนอกอาคาร จัดแสดงเรือประมง 2 ลำ (สีส้มและสีฟ้า) ที่ถูกคลื่นซัดข้ามถนนมาอยู่บริเวณพิพิธภัณฑ์กว่า 2 กิโลเมตร เป็นสัญลักษณ์ให้ระลึกถึงเหตุการณ์ในครั้งนั้นถึงความเสียหาย ความรุนแรงที่เกิดขึ้น 

2. ส่วนบริการ คือ ส่วนที่เจ้าหน้าที่ให้บริการข้อมูล ขายของที่ระลึก และมีห้องฉายวีดิทัศน์เกี่ยวกับสึนามิ

3. ส่วนจัดแสดงนิทรรศการ จัดแสดง 6 โซนนิทรรศการ เล่าเรื่องราวเชื่อมโยงกันไปตั้งแต่ โซน 1–6 เช่น การลำดับเหตุการณ์การเกิดสึนามิ การรับฟังเรื่องเล่าจากผู้รอดชีวิตจากสัญชาตญาณของตนเอง ในขณะที่เกิดคลื่นยักษ์สึนามิ บริเวณหมู่บ้านน้ำเค็ม จำนวน 7 ท่าน ความรู้เบื้องต้นของสึนามิ การเล่าเรื่องจากวัตถุ เช่น อุปกรณ์ เครื่องใช้ของโรงแรม อุปกรณ์การเดินทางของนักท่องเที่ยว รถยนต์ รวมไปถึงการเรียนรู้และการป้องกันภัยในการเกิดเหตุในอนาคต