"นิทรา" อ่านออกเสียงเป็น "ซ" หรือ "ทร"

อยากทราบที่มาทางประวัติศาสตร์ภาษาไทยครับ ว่าเหตุใด ทร จึงออกเสียง ซ ในเมื่อมีหลายคำ จึงน่าจะมีที่มา และเสียง ซ ที่ใช้นั้น ออกเสียงแบบนี้ตั้งแต่สมัยโบราณเลยหรือไม่ครับ รวมถึง เมื่อเทียบกับคำคำเดียวกัน

ทำไมคำว่า อินทรีย์ มัทรี จึงไม่อ่านว่า อิน - ทรี และ มัด - ทรี เหมือนคำว่า อินทรา ภัทรา จันทรา นิทรา คำว่า สุนทรีย์ อ่านว่า สุน - ทะ - รี หรือ สุน - ทรี

ถ้า ท.ทหาร กับ ร.เรือ รวมกันแล้วเป็น ซ.โซ่ แล้วทำไม คำว่า "โทร" ไม่อ่านว่า "โซ" คำว่า "เทรน" ไม่อ่านว่า "เซน" ครับ

ผมค้นหาคำนี้ในอินเตอร์เน็ตแล้วพบว่ามีการใช้คำนี้ทั้ง3แบบ ในประโยคคล้ายๆกันครับ แต่อยากทราบว่าการเขียนคำนี้ที่ถูกต้อง และความหมายที่แท้จริงของคำนี้คืออะไรกันแน่ครับ