นักวิทยาศาสตร์เขานับอะตอมกันยังไงหรอครับ

พอดีผมสงสัยตอนเรียนเคมีกับชีวะ ที่เขาบอกว่า น้ำมี H20 หรือน้ำตาลกลูโคสที่มี C6H12O6

ผมอยากรู้ว่าเขาใช้วิธีอะไรทำไมถึงรู้ว่า น้ำมี H 2อะตอมกับ O 1 อะตอม  
หรือ น้ำตาล เขารู้ได้ยังไงครับว่า มี คาร์บอน  6 อะตอม  บางชนิดมี 5 อะตอม
เขานับกันโดยส่องกล้องจุลทรรศ์หรอครับ