การเดินทาง กทม.-โอซาก้า-เกียวโต-โตเกียว-เซนได-โตเกียว-กทม

ต้องเดินทางไปทำงาน ด้วย route ดังนี้

วันที่ ๑ กทม.-โอซาก้า- / โอซาก้า-เกียวโต
วันที่ ๒ เกียวโต-โตเกียว
วันที่ ๓ โตเกียว-เซนได / เซนได-โตเกียว
วันที่ ๔ โตเกียว-กทม

คำถาม
๑.. ทราบว่าหากใช้พาสปอร์ตเล่มสีน้ำเงิน จะใช้ JR Pass ไม่ได้ มีวิธีอื่นในการเดินทางข้ามเมืองไปมาไหมคะ
๒.. หากใช้พาสปอร์ตเล่มสีน้ำตาล ใช้ JR Pass ได้  แต่ทว่า มีวิธีอื่นในการเดินทางข้ามเมืองไปมาไหมคะ ที่ดีหรือดีใกล้เคียง JR Pass ไหมคะ  
๓.. อื่นที่เป็นประโยชน์สำหรับมือใหม่หัดไปเจแปนค่ะ

ขอบคุณล่วงหน้าค่ะ