ปวดหัวกับการทำเว็บไซต์ มากๆแนะนำที เรื่อง โดนไวรัส

เว็บที่ทำเกิดโดนไวรัส
เสริทร์หาวิธีแก้ไข ส่วนมากก็จะแนะนำให้เอา โค๊ดพวก iframe หรือ  Code ประเภท JavaScript ออกให้หมด
ก็เลยสงสัยว่า ก็ถ้าเราใช้ JavaScript ในการทำเว็บ เพื่อเพิ่ม ฟังชั่น หรือ ลูกเล่น ในเว็บ
แล้วเราก็ต้องเอาโค๊ด ส่วนนี้ออกหมด
แล้วเราจะทำเว็บให้มันมี ฟังชั่นเพิ่มได้ยังไง ( งงไหม )

มันดูงงๆ อะครับ แนะนำด้วยครับ หรืออธิบายให้เข้าใจ ด้วยครับ