ปรึกษาเรื่องภาษา C หน่อยครับ

ถ้าเราจะนำคำสั่งใน Command Prompt มาใส่ในโปรแกรมที่เราเขียน ต้องทำไงครับ
เช่น ถ้าผม if(ch=='a') แล้วให้รันคำสั่ง Command Prompt เช่น cd C: ไรงี้อ่าครับ
ต้องทำยังไงอ่าครับ?