การสำรองข้อมูลแบบ copy & paste (ลง external disk) ต่างกับการ back up files ผ่านระบบปฏิบัติการยังไงคะ?

ปกติเรามัก copy & paste ไฟล์ลงแฮนดี้ไดฟ์ (นานๆ ทีก็สำรองไว้ใน external disk) เพราะ back up ไม่เป็น

อ้างอิง
http://support.microsoft.com/kb/933479/th

คำถาม คือ
1. ความแตกต่างของไฟล์ที่สำรองผ่าน 2 วิธีนี้
2. ข้อดี ข้อเสีย ของแต่ละวิธี