การจองตั๋ว JR กับ shinkansen และรถสายย่อย

จะให้เจ้าหน้าที่ออกตั๋วให้ก่อนครับ
แต่สงสัยว่า เวลาจองต้องจองเฉพาะของ shinkansen ใช่มั้ยครับ
พวก limited express หรือรถไฟสายย่อยอื่นๆ
สามารถยื่น jr pass  ได้เลยหรือเปล่า
ขอบคุณครับ