ลำดับเบสที่ซ้ำกันมากๆ (A/T)15 ทำให้ sequence มัน shift ได้หรือเปล่าครับ

คือทำซ้ำหลายรอบมากผลก็ยังเหมือนเดิม พอผ่านจุดนี้ปุ๊บ sequence อ่านไม่ได้ทันทีเพราะซ้อนทับกันหมดเหมือนมีหลายประชากร

ทำ bidirectional เลยอ่านได้แค่ข้างเดียวที่บริเวณที่ต้องการอ่านอยู่ก่อน A15 ดังภาพ



ส่วนอีกขานึงอ่านไม่ได้เพราะมันจะอ่านเจอ A15 ก่อน
ดังภาพ

คำตอบที่ได้รับเลือกจากเจ้าของกระทู้
ความคิดเห็นที่ 1
หาจาก net ก็ได้นี่ครับ

This is called "polymerase slip". It happens when the growing strand temporarily dissociates from the template, then reassociates at a different spot - say, one nucleotide forward or back from where it started. If this happens often enough (as it will on polyA or polyT templates), every individual band becomes a family of closely-spaced peaks giving a 'roller coaster' look to the chromatogram.

Try sequencing in the other direction from the opposite strand, or try another primer either closer or further from the homopolymer region.
แสดงความคิดเห็น
โปรดศึกษาและยอมรับนโยบายข้อมูลส่วนบุคคลก่อนเริ่มใช้งาน อ่านเพิ่มเติมได้ที่นี่